高等教育研究所成立于1987年，发展规划与内涵建设办公室成立于2012年。2013年，发展规划与内涵建设办公室、高等教育研究所合署办公。2016年，改名为“发展规划处（高等教育研究所）”。

本部门主要职能如下：

1. 组织学校总体事业规划编制工作，指导协调各专项规划、学院规划编制工作，推进规划的评估总结等有关工作。

2. 组织开展学校重大改革方案的前期研究、跟踪落实等工作。

3. 组织实施学科建设重大专项的方案编制、评估与预算管理；组织实施学科建设规划编制、论证与建设成效评估，以及学科建设预算管理等工作。

4. 组织开展上海高校分类评价自评数据采集工作，负责学校事业发展数据统计与分析等相关工作。

5. 开展政策研究，为学校改革与发展提供决策咨询或政策建议。

6. 负责校学术委员会秘书处工作和日常事务。

7. 其他校领导交办的事务。